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在学术成果方面,邵元智博士已在国内外36种学术期刊上发表了77篇论文,其中70篇为第一作者。他的研究成果发表在如Europhysics Letters、Phys.Rev.、J.Appl.Phys.等知名期刊上,以及国内的《科学通报》、《中国科学》和《物理学报》等。
1、年3月,《关于光的产生和转变的一个启发性观点》,文中提出光量子学说和光电效应的基本定律,并在历史上第一次揭示了微观物体的波粒二象性,从而圆满地解释了光电效应。
2、这五篇论文分别是:①《分子大小的新测定》,②《热的分子运动论所要求的静止液体中悬浮小粒子的运动》,③《论动体的电动力学》,④《物体的惯性同它所含的能量有关吗?》,⑤《关于光的产生和转化的一个试探性观点》。第五篇于3月17日发表。
3、爱因斯坦在1905年发表了四篇论文。分别为:《关于光的产生和转化的一个启发性观点》、《根据分子运动论研究静止液体中悬浮微粒的运动》、《论运动物体的电动力学》、《物体惯性与其所含能量有关吗》,随后导出了E = mc²;的公式。
不容易。该期刊的审稿流程相对较为严格,但发表在该期刊上的论文通常具有较高的质量和影响力,能够为作者带来较高的学术声誉和职业发展机会。MolecularSimulation是一本涵盖了分子动力学模拟领域的国际知名学术期刊,由Wiley-VCH出版。
molecular simulation的意思是分子模拟。这是一种通过计算机模拟分子行为和相互作用的科学方法。具体来说:定义:分子模拟利用物理学、化学和生物学的原理,通过计算机算法和程序,模拟分子系统的结构和动态行为。
使用msi2lmp工具转换data文件时,推荐命令为:msi2lmp.exe xxx(car文件名称) -ignore -class 1 -frc D:\xxxx\xxx(路径),务必添加“-ignore”选项,即使势参数不完全匹配,也能确保空间信息的完整性。确保.car文件和.mdf文件在msi2lmp工具文件下时,文件转换过程会更顺畅。
DSSP是一种用于分析蛋白质二级结构的算法,由Wolfgang Kabsch和Chris Sander开发。它通过经典的氢键探测策略,能够准确解析蛋白质中的α螺旋、β折叠等二级结构。DSSP在分子模拟中的应用:在分子动力学模拟中,DSSP常被用于分析模拟得到的蛋白质轨迹文件。
DSSP(蛋白质二级结构字典)由Wolfgang Kabsch和Chris Sander设计,是用于对蛋白质结构中的氨基酸残基进行二级结构分类的标准化算法。该算法基于经典规范定义的氢键探测,是应用最广泛的二级结构定义系统。在使用GROMACS进行分子动力学模拟后,可通过gmx do_dssp命令调用DSSP对蛋白质的二级结构进行分析。
一幅幅蛋白质二级结构的动态画卷就这样在眼前展开,每一道曲线都揭示了分子层面的精密秩序。而这一切,都离不开DSSP的精准解析。
通过DSSP,专业人士可以高效地对数字形状进行采样,提取关键特征,进行分析和处理,从而实现精确的三维模型构建或者对复杂几何形状的高效处理。例如,在分子动力学模拟中,DSSP用于解析蛋白质结构,确定其二级结构类型。
模拟结果显示,C端突变的体系更快速地达到稳定状态,RMSD波动小,回转半径表明C端突变有助于肽在细胞膜上的稳定性。SASA随时间下降,RMSF显示N端氨基酸波动较大。氢键分析显示,C端突变组与水分子和细胞膜之间的氢键较少,有助于稳定结合。快照显示,C端双吡啶突变有效固定了长肽在膜上。
SWISS-PROT是经过注释的蛋白质序列数据库,由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护。