微生物包括：细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等在内的一大类生物群体，它个体微小，与人类关系密切。涵盖了有益跟有害的众多种类，广泛涉及食品、医药、工农业、环保、体育等诸多领域。在我国教科书中，将微生物划分为以下8大类：细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次氏体、支原体、衣原体、螺旋体。
有些微生物是肉眼可以看见的，像属于真菌的蘑菇、灵芝、香菇等。
还有微生物是一类由核酸和蛋白质等少数几种成分组成的“非细胞生物”
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